大多數肺功能檢查儀器支持數據存檔與導出功能，可用于健康檔案管理。像 科進 KPF1000 系列肺功能儀 的軟件一般支持導出 PDF 或 Excel 格式，并能按姓名、日期、編號等信息進行整理。

數據存檔功能方便機構進行長期跟蹤，也可用于健康管理項目中的趨勢分析。對于體檢中心而言，通過數據導出可以與現有系統整合，提高報告處理效率。對于基層單位，則方便建立健康檔案，便于后續回訪或隨訪。

這種數字化管理能力已經成為肺功能檢查儀器的重要組成部分，能夠適配各種健康管理平臺。